La formation est organisée en alternance principalement en formation scolaire ou sous statut d’apprentissage ou en contrat de professionnalisation sur la base de 16 à 18 semaines de formation à la MFR et au moins 20 semaines de formation en entreprise.

Par l’alternance mise en œuvre dans les Maisons familiales rurales les élèves :

découvrent la vie en entreprise,
 entrent progressivement dans le monde des adultes,
poursuivent leur formation générale tout en développant des compétences liées à un métier,

préparent un diplôme et une qualification reconnus,
valorisent leurs qualités personnelles,
s’engagent par étapes dans un parcours de réussite d’abord dans un cycle CAP puis en Bac professionnel et ensuite éventuellement en BTS (Brevet de technicien supérieur).

L’alternance des Maisons familiales rurales associe étroitement les temps de formation en milieu professionnel, les stages, et les temps de formation à l’école. Tous les adultes présents autour du jeune sont engagés dans sa réussite :

le maître de stage fait bénéficier le jeune de son expérience,
l’équipe de formateurs utilise les réalisations des élèves en entreprise pour apporter ou compléter les connaissances théoriques et générales,
la famille joue pleinement son rôle éducatif.
A travers la démarche des Maisons familiales rurales, la formation à un métier n’est plus l’unique finalité. Les méthodes pédagogiques suscitent également l’esprit de curiosité et de recherche, les capacités d’initiative, la prise de parole, la formulation d’un projet... L’alternance permet au jeune de comprendre ce qu’il vit et de développer ce qu’il est.

Dans les MFR qui sont des établissements à taille humaine où chacun est connu et reconnu, les équipes :

écoutent et accompagnent les adolescents par un suivi personnalisé,
mobilisent les parents et les maîtres de stage pour apporter des réponses concrètes aux attentes des jeunes,
proposent une vie de groupe qui facilite l’apprentissage de la responsabilité, du respect de l’autre, de l’autonomie, de la collectivité,
favorisent l’ouverture culturelle par de nombreuses activités.
Dès les démarches d’inscription, un entretien avec le responsable de l’établissement permettra de préciser le ou les projets de chaque jeune et de conseiller les familles.